Генетичка генеалогија

  • Začetnik teme Začetnik teme Kor
  • Datum pokretanja Datum pokretanja
stanje
Zatvorena za pisanje odgovora.
Odnosno, danas ne znamo da li je danasnji E V13 neolitickog porekla, i u tom slučaju bi bio odvojen vremenski od Grčkog na primer više od 3000 godine, ili je mnogo mladji, kao što je pisao Klyosov, ali ja nisam video dokaz za to. Ova studija na diekenes ipak, ako razumem, govori da je današnji E V13 ipak mlad. E v13 jeste geografski poreklom iz Grčke, i u više faza se širio iz južnog Balkana, i pre postojanja Grka kao Grka. Ali jesu i sami Grci zaslužni za njegovo širenje. Kao što si bio pre toga napisao, nema na žalost detaljne grane i starosti u okviru grupe E V13.
Ово истраживање са диенекесовог блога је из 2008 непосредно после првих великих истраживања на европској популацији, када се много тога лупетало. Чак и да је то истраживање урађено како треба, на довољно великом узорку и тако даље, оно би само значило да је Е В13 разноврснији у Грчкој него код Албанаца, Цинцара или Македонаца, то јест да у Nea Nikomedeia-и носиоци Е В13 имају више до заједничког претка.
Katalonija pripada mediteranskom kulturnom horizontu.
Međutim, očigledno, taj E V13, koji je bio pre 6000g, u Kataloniji nije ekpanzirao na tom prostoru.
Kao što nije M 223 iz Lukseburške pećinne. Ili I2 M 423 sa severa Evrope.
Generalno, mnogo je više grana koje su se ugasile, no onih koje su uspešne.
Како можемо знати да ли је Е В13 експанзирао тамо, не знамо ни шта се тачно дешавало пре 1000 година а камоли пре 6000 година. Људи су се селили тамо вамо, нису били пужеви, људи могу прећи огромне раздаљине пешке, кинески комунисти су у Дугом Маршу прешли пешке 10 000 км за годину дана
 
Мишљења да су Бастарни сродни Скордисцима био је само један антички аутор. Сви остали су или то негирали, или су тврдили да су Бастарни германски народ (највише њих), или пак да припадају Скитима. А оно што очигледно опет ниси разумео, Шчукин каже да је бесмислено повезивати их са било којим другим народом, и да су они самосвојни.
Koji je antički autor negirao da su Bastarni i Skordisci srodni?
Znači i Skiti su I2a din?
 
Poslednja izmena:
Ово истраживање са диенекесовог блога је из 2008 непосредно после првих великих истраживања на европској популацији, када се много тога лупетало. Чак и да је то истраживање урађено како треба, на довољно великом узорку и тако даље, оно би само значило да је Е В13 разноврснији у Грчкој него код Албанаца, Цинцара или Македонаца, то јест да у Nea Nikomedeia-и носиоци Е В13 имају више до заједничког претка.

Како можемо знати да ли је Е В13 експанзирао тамо, не знамо ни шта се тачно дешавало пре 1000 година а камоли пре 6000 година. Људи су се селили тамо вамо, нису били пужеви, људи могу прећи огромне раздаљине пешке, кинески комунисти су у Дугом Маршу прешли пешке 10 000 км за годину дана
Nema njihovih tragova u današnjoj populaciji na tim prostorima.
Analiza varijansi, otprilike, daje sliku kako se širila današnja E V-13 populacija.
Ako se desio fantastični scenario da je sav E V13 bio na iberijskom poluostrvu, pa se odselio, on se odselio na Kipar, pa se odatle dalje širio.
I pitanje je da li se više lutalo pre 2008g., ili su posle neki zalutali.
 
Koji je antički autor negirao da su Bastarni i Skordisci srodni?
Znači i Skiti su I2a din?

По свом старом лошем обичају извучеш из контекста нешто што ти се допада, а све оно друго што тврди супротно од тога ти сметеш под тепих. Овом приликом допала ти се изјава Тита Ливија који каже "That the road to the Adriatic Sea and Italy was through the country of the Scordiscians, and that the army could not be led by any other way; that the Scordiscians would readily grant a passage to the Bastarnians, for they would have no dislike to people resembling themselves in language and manners and would probably join them in an expedition, when they saw that they were on their way to the plunder of a most opulent nation." Ухватио си се за "resembling themselves in language and manners" и то преиначио у "сродни". Да ли ћеш и када на улици сретнеш некога ко личи на неког твог познаника, одмах да закључиш да су они рођаци? Дакле, из онога што Ливије каже извукао си оно што се теби свиђа, а све остале античке ауторе си гурнуо под тепих. Осећам како ћеш још да кажеш како Страбон „није научник у области“, бога ти, па он је географ, није историчар. А што се Тацита тиче, па он је дуго боравио код Германа и потпао је под „германски утицај“.

Елем, Тацит за Бастарне каже: „in language, social habits, mode of settlement and dwelling are like Germans“, дакле потпуно исто што каже и Ливије, само што их Ливије упоређује са Скордисцима, а Тацит са Германима. И да не наводим сада шта кажу Страбон и Плиније, кажу нешто слично Тациту. На основу чега ти прихваташ Ливија и одбацујеш све остале, ако то није из субјективних разлога, због симпатија према ономе што је Ливије написао?

Слично је и са Скордисцима. Ухватио си се за мањину аутора који тврде да Скордисци нису келтског порекла, а игноришеш ону већину који тврде да јесу. Од античких аутора Страбон јасно каже да Скордисци јесу Келти, при чему оставља могућност да су се мешали са Илирима и Трачанима. Али, добро, заборавио сам да Страбон није „научник из области“.

Ја сам ти наводио разна гледишта о етничком пореклу Бастарна како би ти из тога сам извукао закључак да је бесмислено везивати Бастарне за било који појединачни етнос, и чак сам ти навео и мишљење угледног руског археолога, једног од оних који је највише проучавао Бастарне, који јасно каже да је бесмислено повезивати Бастарне са било којим другим народом, да су они самосвојни. Али ти и то изокрећеш и вулгаризујеш.
 
Poslednja izmena:
Мишљења да су Бастарни сродни Скордисцима био је само један антички аутор. Сви остали су или то негирали, или су тврдили да су Бастарни германски народ (највише њих), или пак да припадају Скитима. А оно што очигледно опет ниси разумео, Шчукин каже да је бесмислено повезивати их са било којим другим народом, и да су они самосвојни.

Germani ili Skiti, nemoze i jednoo i drugo. Bilo jedno ili drugo, gde su markeri Germanski, a gde Skitski ?
 
По свом старом лошем обичају извучеш из контекста нешто што ти се допада, а све оно друго што тврди супротно од тога ти сметеш под тепих. Овом приликом допала ти се изјава Тита Ливија који каже "That the road to the Adriatic Sea and Italy was through the country of the Scordiscians, and that the army could not be led by any other way; that the Scordiscians would readily grant a passage to the Bastarnians, for they would have no dislike to people resembling themselves in language and manners and would probably join them in an expedition, when they saw that they were on their way to the plunder of a most opulent nation." Ухватио си се за "resembling themselves in language and manners" и то преиначио у "сродни". Да ли ћеш и када на улици сретнеш некога ко личи на неког твог познаника, одмах да закључиш да су они рођаци? Дакле, из онога што Ливије каже извукао си оно што се теби свиђа, а све остале античке ауторе си гурнуо под тепих. Осећам како ћеш још да кажеш како Страбон „није научник у области“, бога ти, па он је географ, није историчар. А што се Тацита тиче, па он је дуго боравио код Германа и потпао је под „германски утицај“.

Елем, Тацит за Бастарне каже: „in language, social habits, mode of settlement and dwelling are like Germans“, дакле потпуно исто што каже и Ливије, само што их Ливије упоређује са Скордисцима, а Тацит са Германима. И да не наводим сада шта кажу Страбон и Плиније, кажу нешто слично Тациту. На основу чега ти прихваташ Ливија и обдацујеш све остале, ако то није из субјективних разлога, због симпатија према ономе што је Ливије написао.

Слично је и са Скордисцима. Ухватио си се за мањину аутора који тврде да Скордисци нису келтског порекла, а игноришеш ону већину који тврде да јесу. Од античких аутора Страбон јасно каже да Скордисци јесу Келти, при чему оставља могућност да су се мешали са Илирима и Трачанима. Али, добро, заборавио сам да Страбон није „научник из области“.

Ја сам ти наводио разна гледишта о етничком пореклу Бастарна како би ти из тога сам извукао закључак да је бесмислено везивати Бастарне за било који појединачни етнос, и чак сам ти навео и мишљење угледног руског археолога, једног од оних који је највише проучавао Бастарне, који јасно каже да је бесмислено повезивати Бастарне са било којим другим народом, да су они самосвојни. Али ти и то изокрећеш и вулгаризујеш.
I

Kyrios, ipak previse raznih objasnjenja o poreklu Bastarna, tako da je stvarno tesko doci do pravog zakljucka. I upravo zbog toga, tesko je njih vezati za I2a din.
 
The ancient Bulgarian is sitting more or less where modern Bulgarians are usually found on such global plots. On the other hand, the ancient Dane is clearly shifted towards East Asia, and as a result clusters with Finns, which I suppose is somewhat unexpected because that never happens with modern Danes. So either there's a problem with the analysis, like, say, projection bias (see below for more details), or this Bronze Age Dane was in fact more eastern in terms of global genetic affinities than modern Danes. The latter might well be true if, for instance, he was a recent descendant of migrants from the east (like present-day Russia), and/or he harbored more Mesolithic hunter-gatherer ancestry than Danes do today.
[/QUOTE]
 
Poslednja izmena:
О пореклу Срба и њиховој ма­ти­чној територији постоји више тео­рија. Када и где, према вашим сазнањима, започиње историја српског народа?

Прво морамо да одредимо појам народа, да одредимо његове археолошке особине, а онда да га испратимо у прошлост колико је то могуће. Морамо имати на уму да се народи временом мењају, да упијају у себе друге народе, док се њихови припадници утапају у инородне народе.

Српско име види се као самоназив индо-иранског или индијског порекла, што указује на доба образовања Индоевропљана. Те везе потврђују топоними, неки митови, религиозна схватања и друго. Археолошки, по мојим истраживањима, Срби су потомци оних Илира који су настањивали подручје између Ибра, Јадрана, Купе и Саве. Они настају из Цетинске културе, која се образовала у првој половини II миленијума пре Христа. Од тада до данас на том простору живи становништво мање више исто по антрополошком типу, а и културно, такозваног динарског антрополошког типа. Међутим, то је донета култура, што значи да су њени носиоци негде живели пре тога.

Топоними са српским именом данас се могу наћи од Ирана до Индије. Магловито се назире једна старија епоха Словена и Срба коју треба повезати са неолитом Мале Азије и Југоисточне Европе, коме насупрот стоји просечно млађи неолит Средње и Западне Европе, са особинама које се дуго могу пратити код Германа, као што је изглед куће (а она одражава породицу). Још дубљу и магловитију прошлост наилазимо код Срба и данас у виду сећања на потоп, иначе запамћен у Старом свету, у Ирану, Индији, Израелу. То су предања о алкама на врховима наших планина, за које су некада били везивани бродови. На другој страни, неке природне науке сада независно истражују гене, крвне групе и слично, и долазе до занимљивих открића, упркос отпору који се код нас пружа пре свега из круга археолога и антрополога повезаних са немачком науком.
http://www.ceopom-istina.rs/nekategorizovano/zabran-ena-arheologija-istorija-srba/
 
Germani ili Skiti, nemoze i jednoo i drugo. Bilo jedno ili drugo, gde su markeri Germanski, a gde Skitski ?

A i to postane vrlo problematično, ako se setimo akcije "lebensborn":

Стотине хиљада малих светлокосих и светлооких Руса, Пољака, Чеха и Срба нацисти су током Другог светског рата одвели у Немачку да би од њих направили аријевце – подсетили су ових дана руски историчари у јавним наступима, изиритирани све чешћим немачким покушајима да у књигама и филмовима ревидирају историју.
Реч је о једном од масовних експеримената над људима који је изводио СС покрет под командом Хајнриха Химлера. Званично, програм „производње аријеваца“ започет је 1935. у нацистичкој Немачкој. Међутим, недавно је др Гунар Броберг, професор историје науке на шведском Лунд универзитету, открио много дубље корене зла.

После победе 1945. амерички војници су пронашли стотине хиљада досијеа словенских малишана које су отели нацисти. Испоставило се да је то само мањи део досијеа „Лебенсборна“. Американци су саслушавали у намери да их врате кућама, али многи малишани се нису сећали своје прошлости, заборавили су матерњи језик, осећали су се као Немци и бојали се да их не одвоје од усвојитеља. Старијој деци у процесу „германизације“ мозгови су буквално испрани и само су тупо понављала да је „срећа бити аријевац“. Савезници су убрзо прекинули истрагу, а свега два-три одсто „лебенсборн“ деце враћено је у отаџбину.

Једна од ретких која је сазнала свој прави идентитет је Марија Долежалова Шупикова из чешког села Лидице, која је имала десет година када су нацисти Лебенсборн31942. збрисали њено родно место. Све мушкарце су стрељали, жене упутили у конц-логор, а над 105 малишана СС официри су на лицу места обавили „тест аријевства“. Одабрали су 23 малишана, а 40 дечака и 42 девојчице су стрељали.

Марија Долежалова Шупикова је с одабранима упућена у дечији конц-логор у Лођу где је прошла и другу тријажу, а затим јој је дат нови идентитет – Ингеборг Шилер. После тога је годину дана „преваспитавана“ испирањем мозга и тешким батинама, уколико би употребила матерњи језик. На крају је упућена у немачку породицу.

- Ми који смо доспели у хранитељске породице били смо захвални за нове родитеље. Били смо срећни што нас нису побили, што смо живи – каже Марија Долежалова Шупикова, чији су досије по ослобођењу открили амерички истражитељи и спојили с мајком која је од напорног рада у логору остала парализована. Несрећна девојчица је 1947. сведочила на суђењу нацистима у Нирнбергу

- Једино што сам сазнао јесте да сам са Крима. Постао сам Немац као једно од деце „Лебенсборна“ – каже Александер Литау, пензионер из Хамбурга,

http://zakrstcasni.org/zkc/?p=342
http://colanmc.siu.edu/clockwork/papers/p13.htm

Where disappeared 50 000 kids stolen by SS-men in the USSR?
http://ru-facts.com/news/view/711.html
http://www.ghetto-theresienstadt.info/pages/s/supikovam.htm
 
Poslednja izmena:
Mislim da sam uhvatio Albance Gege.
http://www.familytreedna.com/public/Abanian_DNA_Poject/default.aspx?section=ysnp
http://www.familytreedna.com/public/I2nosubcladeM170P215/default.aspx?section=ymap
http://www.familytreedna.com/public/r1b1b2/default.aspx?section=ymap

Njihov R1b je L23+, L51-. Obratite pažnju na savke H i H.a. u padajućoj listi.
Kavkaska Albanija?
http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpR.html

Gaguzi
http://www.medgenetics.ru/UserFile/File/Varzar.pdf
R1b?
http://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_E1b1b_Y-DNA.shtml
https://www.google.rs/url?sa=t&rct=...scent/file/79e415113656d8b8c7.pdf&ei=6EbOUtD-

Pečenezi
http://sr.wikipedia.org/sr/Печенези

http://dienekes.blogspot.com/2010/03/y-chromosomes-of-albanian-populations.html
U ovom istraživanju nsu radili analizu R1 populacije, an ni komparaciju sa Anadolom i Kavkazom (neshvatljivo), ali ima zanimlljivih detalja u vezi E V-M26
Zanimljivo da u sadašnjosti imaju dosta poklapanja sa Grcima, međutim u dubokoj prošlosti nije zanemarljiv deo koji ih vezuje sa Egiptom (naročito Gege).
Gledajući njihov uzorak u Makedoniji barem 10% E V-M26 nije ni M78.
A i imamo od 1 do 5% E V13 u Egiptu, Izraelu...
Meni se ovo još uklapa u Kadmijce
Kasd se malo pogleda, ova poklapanja sa Egiptom, prolaze kroz "uska grala".
http://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_E1b1b_Y-DNA.shtml
Haplogroup-E-V13.gif

...
http://www.genebase.com/AEA9ECA3-99...dnaHaplogroup_H_Subclade_Distribution_Map.pdf
 

Prilozi

Poslednja izmena:
Иво једног истраживања ширења Р1а хаплогрупе, у коме је учествовао и рауски академик Животовски, којеи је и развио коришћену методологију.
Овде је процена да је М 458, на западном Балкану присутна од пре 5000 - 7500 г. (Приморац је био део тима).
Подсећам да је, применом исте методологије, за пет од 109 узорака из српске популације, старос процењена на 14000г. И бугарска истраживања потазују велику старост.
Треба имамти на уму да вишеструке миграције, вештачки повећавају старост.
У сваком случају нема говора о 1300 година.
З 280 је, код нас, већ млађа.
http://www.nature.com/ejhg/journal/v18/n4/full/ejhg2009194a.html
ejhg2009194f2.jpg

Komentar, iz Srbije, sa jednog drugog, poznatog nam, foruma
"We can be conservative and ignore all new researches. We can say science no longer has anything new to say. We can stay in the belief that I2a2 and R1a came to the Balkan 1,500 years ago with Slavs and deny new findings.

But science is progressing. You can see Regueiro et al. (2012) claim about Balkan I2a2 9,000 years ago. And in the debate that I had with Sparkley we reduced for 3x claims these authors. Results is I2a2 in the Balkans is 3,000 years ago. It is much earlier than Slavic expansion.

For R1a things are more apparent. R1a in the Balkans is very very old. You know a lot of authors have claimed, not only Regueiro et al. Probably from all today's haplogroups in the Balkans R1a is the oldest. And Regueiro et al. find only 5,8% R1a-M458 among Serbs, versus older 14,8%.

You can see that R1a is very stable in the Balkans. All Balkan populations have a share R1a, in fairly equal measure. Understandably, Croats and Slovenes have the most (due to the movements of Slavs), but every Balkan population has. R1a came in three big waves in the Balkans, first wave was a long long time ago, estimates of different scientists ranging from 20,000 years to 7,000 years.

Today, who says that R1a came to the Balkans first time with Slavs in the 5th century is similar as to say that atoms are the smallest known particles, that no new elements after Mendeleyev or that planets in Solar systems are the only planets in the Universe. But science has advanced and we know that this is no longer true.

For me it is interesting to find out to which haplogroups belonged the members of old Balkan cultures, for example people who created the culture at Lepen Whirl, eastern Serbia (peak about 7,000 years ago). Skeletons of these people has been saved and probably it is possible to determine haplogroups (I started thread on it).

Also Vincha culture (Serbia, Romania) who had early period (7,500-6,800 years ago) and late period (6,800-6,200 years ago). Researches of this kind will surely be performed and we see results."
Još jedan zanimljiv rad. Opet nemamo Srbe iz Srbije, ali imamo "bosanske Srbe".
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2947100/
"Differently from the earlier discussed Hgs, I-M423 represents the southeast European autochthonous clade of I-P37.2. Its distribution reaches Anatolia, where, however, it is only sporadically observed (2.6%, updated from Rootsi et al23). Also, virtually, all the I-P37.2* paragroup members identified in this survey harbouring the peculiar DYS388-15 trinucleotide repeat motif (not observed in any other Hg I clade) likely represent a new rare P37.2 sub-clade. Their distribution (Supplementary Table S1) and the associated YSTR variation age of ∼4000 years (Table 1) suggest that they expanded demographically, perhaps from central European regions during the Bronze Age. In this scenario, the only I-P37.2* chromosome observed in Albania, not characterized by the unusual DYS388-15 repeat motif marker, could either represent the consequence of a reversion event back to the ancestral allele or be a rare representative of the ancestral P37.2 state.
The network of the STR haplotypes identified in 222 Y chromosomes belonging to the I-M423 Hg (Supplementary Figure S1) is characterized by a star-like shape centred on the most frequent and diffused haplotype that is present in all Balkan populations. The marginal positions occupied by the three Turkish chromosomes are in agreement with a recent gene flow. The age of accumulated microsatellite variation associated with Hg I-M423 (Table 1) dates to around 8000 years ago (Early Holocene). Thus, although Hgs G and J mark the successful colonization and subsequent demic expansions of Neolithic pioneers to these regions, consistent with a wave of advance,19, 65 the widespread adoption of farming by Mesolithic hunter-gatherers in the Balkans and Central Europe is recorded in the autochthonous Hg I-M423.

These data indicate the complex interactions between farmers and foragers rather than the large-scale replacement of hunter-gatherers by pioneering agriculturalists during the spread from the Neolithic to the southeast Europe. The data also indicate that I-M423 and probably also E-V13 representatives would have been well established in the Balkans before the arrival of a nucleus of pioneering agriculturalists."

Pogledajde u I-M423 tru Turčina iz Konje.
Haplogroup (N) Age of microsatellite variationa ±SEb (ky) Mean variancea
I-P37*-DYS388-15 (28) 4.0±1.7 0.107
I-M423 (219) 7.8±2.3 0.198
E-V13 (92) 5.9±1.7 0.155
J-M410* (23) 15.8±3.8 0.410
J-M67 (42) 11.0±2.4 0.287
J-M67* (32) 11.2±2.9 0.298
J-M92 (10) 7.0±1.9 0.187
J-DYS445-6 (10) 7.7±2.6 0.164
J-M12 (51) 7.4±1.4 0.191
J-M12/102* (15) 12.3±2.7 0.332
J-M241 (34) 4.8±1.3 0.121

Expansion of E-V13 and I-M423 from the Balkans http://dienekes.blogspot.com/2008/12/expansion-of-e-v13-and-i-m423-from.html
"The most interesting aspect of this paper is that it supports a European rather than Middle Eastern origin of E-V13 and I-M243 based on an analysis of relative Y-STR variance. However, the age estimates presented in this paper are based on the infamous "evolutionary mutation rate", and are thus suspect. What appears as "Mesolithic" using the wrong mutation rate is actually Bronze Age, although with hefty confidence intervals."


Šteta što ovde nemao i Srbe iiz Srbije.
Evo istraživanja srpske populacije iz 2012.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S037811191200073X#gr4c
Šteta što "zvezda" nije free.
 
Poslednja izmena:
Иво једног истраживања ширења Р1а хаплогрупе, у коме је учествовао и рауски академик Животовски, којеи је и развио коришћену методологију.
Овде је процена да је М 458, на западном Балкану присутна од пре 5000 - 7500 г. (Приморац је био део тима).
...
Pogledajde u I-M423 tru Turčina iz Konje. Ako su, u skorijoj istoriji otišli sa Balkana, očekivalo bi se da su više povezani sa balkaskom populacijom.
Haplogroup (N) Age of microsatellite variationa ±SEb (ky) Mean variancea
I-P37*-DYS388-15 (28) 4.0±1.7 0.107
I-M423 (219) 7.8±2.3 0.198
E-V13 (92) 5.9±1.7 0.155
J-M410* (23) 15.8±3.8 0.410
J-M67 (42) 11.0±2.4 0.287
J-M67* (32) 11.2±2.9 0.298
J-M92 (10) 7.0±1.9 0.187
J-DYS445-6 (10) 7.7±2.6 0.164
J-M12 (51) 7.4±1.4 0.191
J-M12/102* (15) 12.3±2.7 0.332
J-M241 (34) 4.8±1.3 0.121
Šteta što ovde nemao i Srbe iiz Srbije.


Набацаш брдо сирових података, позовеш се на милион радова, у којима ниси прочитао ништа више од апстракта. И онда, наравно, изврнеш то што пише у радовима (тј. апстрактима) онако како теби одговара.

Хајде, када се тако често позиваш на ове податке који се тичу микросателитске варијације, објасни нам шта је то микросателитска варијација, шта су уопште микросателити, која је њихова улога у изучавању генеалогије, и које су им предности и ограничења.

Evo istraživanja srpske populacije iz 2012.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S037811191200073X#gr4c
Šteta što "zvezda" nije free.

Ако си на ово мислио изволи, и протумачи нам шта то значи, ако разумеш.

ieff.jpg
yhno.jpg
 
Prvo ništa nisam izvrno. Sve su citati, nigde nema mog zaključka.
Drugo ako zanš da nisam pročitao ništa osim apstrakta, onda znaš da ne znam ništa.
Zašto mi onda tražiš da ti objašnjavam?

Svejedno, svaka čast za slike. Mnogo govore. Šeta što nisam ništa pročitao pa ne mogu rastumačiti.

Ако се позиваш на "аge of microsatellite variation", а то си радио већ више пута, требало би да знаш шта су то микросателити и микросателитска варијација, где могу успешно да се користе, а где не могу... Ако то не знаш, онда не знаш о чему говориш...
 
Poslednja izmena:
Gde sam se ja pozvao na "аge of microsatellite variation"?

Pozvali su se: Vincenza Battaglia,1 Simona Fornarino,1,12 Nadia Al-Zahery,1 Anna Olivieri,1 Maria Pala,1 Natalie M Myres,2 Roy J King,3 Siiri Rootsi,4 Damir Marjanovic,5,6 Dragan Primorac,7,8 Rifat Hadziselimovic,5 Stojko Vidovic,9 Katia Drobnic,10 Naser Durmishi,11 Antonio Torroni,1 A Silvana Santachiara-Benerecetti,1 Peter A Underhill,3 and Ornella Semino1,*, i zaključili:
. The age of accumulated microsatellite variation associated with Hg I-M423 (Table 1) dates to around 8000 years ago[/B] (Early Holocene). Thus, although Hgs G and J mark the successful colonization and subsequent demic expansions of Neolithic pioneers to these regions, consistent with a wave of advance,19, 65 the widespread adoption of farming by Mesolithic hunter-gatherers in the Balkans and Central Europe is recorded in the autochthonous Hg I-M423..
 
Poslednja izmena:
Ако си на ово мислио изволи, и протумачи нам шта то значи, ако разумеш.

ieff.jpg
yhno.jpg

Da probam.
Ovo je mreža STR haplotipova.
I M258
Prvo bosanski, srpski i hrvatski I M258 idu zajedno, tako da je reč o praktično jednoj populaciji.
Centralnu poziciju zauzima najfrekventnij haplotip. On je zastupljen u skoro svim populacijama. Ovde su Srbi procentualno zastupljeniji od Hvata i Bosanaca, a u odnosu na ostale haplotipove. A naročito Makedonci.
Od centra imamo dve dugačke grane. Jednu ukrajinsko - rumunsko - albansku i drugu severnu.
Prva je jedina grana u kojoj, nema Srba. Na periferiji se javlja haplotip, koji se pojavljuje kod Bosanaca i Hrvata. Ovo ide u prilog albansko - rumunskih lingvističkih veza.
Veza druge grane sa centrom je preko malo zastupljenih haplotipova, kojih ima u Bosni, Sloveniji, Hrvatskoj, Mađarskoj, Poljskoj... Onda se javlja jedan frekventan tip ove grane u koga ima i među Srbima, i on je važno čvorište (Galicija?) Na periferiji je jedan mlad, frekventan haplotip, koji je zastupljen među Srima, Aromunima, Makedoncima, Grcima. (Povratak sa severa?). Paralelno imamo i granu koja preko Ukrajinaca dolazi do Hrvata i Bosanaca.
Dalje imamo još tri uspešna haplotipa kod samog centra. Jedan od njih ima frekventan podtip koji je zastupljen kod Ukrajinaca, Aromuna i Slovenaca.
Ovda se vidi šta povećava varijansu u Ukrajini. Svaka grana ostavi traga u Ukrajini.

Slično je i sa E1b1 Najfrekventniji haplotip u centru, dve grane jedna italijansko - albanska, a druga srpsko - palestinska. Na albanskoj grani imamo dva frekvantnija haplotipa, jedan stariji koga najviše ima u Italiji, i drugi mlađi, koga pored Albanaca ima i kod Turaka, Srba i Hrvata. Ujedno, ovo je skoro jedini haplotip na Albanskoj grani koji je zastupljen kod Srba.
Zanimljiv je i jedan frekventan haplotip, odmah do centra, koji je zastupljen na Kritu, u Grčkoj, kod Aromuna i kod Palestinaca. Možda bi ovaj tip mogao bit i stariji od centralnog, onaj koji je došao sa Bliskog Istoka (Mikejci)?.

R1a je priča za sebe. Levo i dole je Z 93, izvesno.
Međutim, sve ostalo nije. Trebalo je barem izdvojiti M458.
U ovom delu centralu poziciju zauzima jedna slabo frekventna rusko centraloevrpska grupa. Rekao bih da bi ovde pre ova grupa bila veza sa Z 93.
Inače sve ovo ne treba uzimati zdravo za gotovo, sve je u domenu verovatnoće.
Oko ovog čvora se javljaju Srbi.
Gore bi, onda bila M458, sa dva najfrekventnija haplotipa zastupljna najviše u centralnoj Evropi, a dole Z 280, rusko centraloevropski frekventan haolotip.
A onda najveće iznenađenje.
Haplotip najviše zastupljen kod Srba. Ima ga po celom svetu: Rusija, Centralna Evropa, istočna Evropa, u podgrupi južna Evropa i južna Azija i najčudnije najviše turskog i najviše srpskog R1a je jedan te isti STR haplotip. Pored ovoga, u okruženju ima dosta južnoazijskih i centralnoazijskih grana.
Treba videti o čemu se ovde radi.
Pogledati 3. B3*. Z282+ M458- Z280- Z284- Western Eurasian branch, cluster B3 (West Asian)
http://www.familytreedna.com/public/r1a/default.aspx?section=ymap
Ako se pogleda desna strana mreže, Srbi su na liniji koju čini 6 slabofrekventnih STR haplotipova. Ova linija je prakrično kičma oko koje se vrše sva grananja. Nema ih na perifernim ograncima.

PS
Kada uporedim oblike ove tri mreže, čini mi se da one jasno govore da su I2a i E1b1 statične populacije, sklone sedelačkom načinu živote, dok je R1a mobilnija, sklonija nomadskom načinu života.

Slična je i zvezda I M258 zvezda u Y-chromosomal evidence of the cultural diffusion of agriculture in southeast Europe radu http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2947100/
Ali su nepravilno razdvojili populacije. Izdojili su Slovence i Hrvate u jedno grupu (neka nadrasa, šta li) Bosance u drugu, Albance i Makednce u jedu, a videli smo da nisu bliski, kao i Rumuni sa Poljacima , gde su ih grupisali.
Ipak vidi se grupisanje oko jakog haplotipa u kome je zastupljenija južna grupa. Vide se i istočna i severna grana. Ipak bi ova tri Turčina mogla biti iz neke skorije migracije.
Na ovoj zvezdi su prikazane i alternativne veze koje nisu prikazane na gornjim prikazima. Zato ima prostora da se ona gore pominjana R1a kičma za nijansu drugačije prepakuje.
Ode se jasno vidi da je južnija populacija bliža centru širenja u odnosu na mađarsko-poljsko-ukrajinsku.
Reklo bi se i južna i bosanska u odnosu na slovenačko - hrvatsku.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2947100/bin/ejhg2008249x1.pdf
 
Poslednja izmena:
Gde sam se ja pozvao na "аge of microsatellite variation"?

Pozvali su se: Vincenza Battaglia,1 Simona Fornarino,1,12 Nadia Al-Zahery,1 Anna Olivieri,1 Maria Pala,1 Natalie M Myres,2 Roy J King,3 Siiri Rootsi,4 Damir Marjanovic,5,6 Dragan Primorac,7,8 Rifat Hadziselimovic,5 Stojko Vidovic,9 Katia Drobnic,10 Naser Durmishi,11 Antonio Torroni,1 A Silvana Santachiara-Benerecetti,1 Peter A Underhill,3 and Ornella Semino1,*, i zaključili:

А шта ћемо са овим?

What are the differences between Y-DNA STR and Y-DNA SNP testing?
Y-STR and Y-SNP are two different kinds of DNA markers (mutations) found in the Y-DNA. For STR markers, a short stretch of DNA is repeated over and over again, and the number of repeats (reported as allele values) vary from one person to another. Some STR markers contain a wide range of repeats, like Y-STR marker DYS385a/b which has a repeat range of 6 to 28. On the other hand, some STR markers like DYS 426 contain a narrow range of repeats, spanning from 10 to 13.

SNP markers are mutations in a single nucleotide (represented as a letter, either A, T, C or G). For example, the ancestral allele for Y-SNP marker M207 is A, and the mutation for this marker is known to be A to G. If result of testing M207 is G, then it is considered a mutation. Unlike Y-STR markers which can have multiple repeats, SNP markers often only exist in 2 forms - the ancestral and the mutated allele.

The major difference between Y-DNA STR and Y-DNA SNP tests is that they examine different kinds of Y-DNA markers. Y-STR markers are useful in tracing recent paternal ancestry and allows the calculation of MRCA (most recent common ancestor) when comparing different individuals to see how long ago they shared a common ancestor. Y-DNA SNP markers are useful in tracing deep ancient paternal ancestry and Y-DNA SNP markers are used to define phylogenetic relationships in the Y-DNA phylogenetic tree. Each Y-DNA haplogroup and subclade in the phylogenetic tree is defined by an unique and specific set of Y-DNA SNP markers.

Или са овим?

Y-STR and Y-SNP markers
A Y-chromosome contains sequences of repeating nucleotides known as short tandem repeats (STRs). The number of repetitions varies from one person to another and a particular number of repetitions is known as an allele of the marker. Individual Y-DNA sequences or STRs which have proved useful in genealogical DNA work are called markers. STRs are mutations that happen on branches of the Y chromosome trunk. Even though they mutate rarely but they mutate much more than SNPs. From a father to a son 150 thousand STRs mutate out of millions existing STRs on the Y chromosome trunk that is composed of 2 billion blocks stacked as along thread. However for Genetic genealogy purposes only several predetermined STRs are assigned for study and comparison between peoples and nations out of the millions of existing STRs. A match of 50 STRs between two males means they are brothers, the less matches the less relatedness but the compared males have to have same SNP (Y haplogroup or subclade). STRs are used to study recent genealogy (in the 4000 years before present such as surname studies) while SNPs are used to study old genealogy (mainly more than 4000 years before present to determine genealogy (ancestry of nations such as ancient Greek for example).

A single-nucleotide polymorphism (SNP) is a change to a single nucleotide in a DNA sequence. The relative mutation rate for an SNP is extremely low. This makes them ideal for marking the history of the human genetic tree. SNPs are named with a letter code and a number. The letter indicates the lab or research team that discovered the SNP. The number indicates the order in which it was discovered. For example, M173 is the 173rd SNP documented by the Human Population Genetics Laboratory at Stanford University, which uses the letter M. SNPs are mutations from the original and happen on the blocks of the trunk of the Y chromosome and happen much less frequently than STRs. From father to son hardly one SNP happen on all the Y chromosome trunk. A random SNP happens on average every two to three generations.


Da probam.
Ovo je mreža STR haplotipova.
I M258
Prvo bosanski, srpski i hrvatski I M258 idu zajedno, tako da je reč o praktično jednoj populaciji.
Centralnu poziciju zauzima najfrekventnij haplotip. On je zastupljen u skoro svim populacijama. Ovde su Srbi procentualno zastupljeniji od Hvata i Bosanaca, a u odnosu na ostale haplotipove. A naročito Makedonci.
Od centra imamo dve dugačke grane. Jednu ukrajinsko - rumunsko - albansku i drugu severnu...

Нисам баш сигуран да си добро разумео. Боље ти проучи ово пре но што наставиш са "тумачењем".

http://mbe.oxfordjournals.org/content/16/1/37.full.pdf
http://dna.ac/filogeografia/PDFs/networks/Posada&Cran_01_networks&geneal.pdf
http://homepages.ulb.ac.be/~pmarduly/Publications_files/Mardulyn2012.pdf
 
А шта ћемо са овим?
Или са овим
Ništa
Нисам баш сигуран да си добро разумео. Боље ти проучи ово пре но што наставиш са "тумачењем".

http://mbe.oxfordjournals.org/content/16/1/37.full.pdf
http://dna.ac/filogeografia/PDFs/networks/Posada&Cran_01_networks&geneal.pdf
http://homepages.ulb.ac.be/~pmarduly/Publications_files/Mardulyn2012.pdf
Gde sam pogrešio?
 
Poslednja izmena:
Gde sam pogrešio?

Па тамо где и обично грешиш. Прво, залатиш се са закључцима, износиш их пре но што си створио било какву основу за закључивање. Друго, потпуно си нејасан, питам се да ли је и теби самом јасно то што пишеш.

На пример, кажеш "Ovde su Srbi procentualno zastupljeniji od Hvata i Bosanaca, a u odnosu na ostale haplotipove. A naročito Makedonci." Шта ти то значи? Где су то Срби процентуално заступљенији од Хрвата и Босанаца? Даље, кажеш: "Od centra imamo dve dugačke grane. Jednu ukrajinsko - rumunsko - albansku i drugu severnu." Шта ти је то "украјинско-румунско-албанска" грана, а шта "северна" грана? И даље: "Na periferiji se javlja haplotip, koji se pojavljuje kod Bosanaca i Hrvata. Ovo ide u prilog albansko - rumunskih lingvističkih veza." Какве тек ово везе има?

Кажеш и "Veza druge grane sa centrom je preko malo zastupljenih haplotipova, kojih ima u Bosni, Sloveniji, Hrvatskoj, Mađarskoj, Poljskoj... Onda se javlja jedan frekventan tip ove grane u koga ima i među Srbima, i on je važno čvorište (Galicija?)" О овим "мало заступљеним хаплотиповима" ћу мало касније, овде ме занима о каквом "чворишту" говориш? И шта ту убацујеш Галицију? Затим кажеш: "Na periferiji je jedan mlad, frekventan haplotip, koji je zastupljen među Srima, Aromunima, Makedoncima, Grcima. (Povratak sa severa?)." Шта ти значи "млад хаплотип"? На основу чега си закључио да је "млад"? Осим тога, кажеш и: "Paralelno imamo i granu koja preko Ukrajinaca dolazi do Hrvata i Bosanaca." Који су ти то Украјинци, а који Хрвати и Босанци?

Да видимо и ово: "Dalje imamo još tri uspešna haplotipa kod samog centra." Шта ти је то "успешан хаплотип"? Или: "Jedan od njih ima frekventan podtip koji je zastupljen kod Ukrajinaca, Aromuna i Slovenaca." Шта ти је то "подтип"? Коначно, кажеш и: "Ovda se vidi šta povećava varijansu u Ukrajini. Svaka grana ostavi traga u Ukrajini." О каквим "гранама" говориш?

Да не идем даље, све је препуно небулоза. Једино што си погодио је то да неки чворови у мрежи представљају STR хаплотипове, да величина кружића одговара фреквенцији тог хаплотипа, а да пита у кружићу представља регионалну заступљеност хаплотипа. Не могу да докучим како си схватио значење грана у тој мрежи, али из контекста могу са сигурношћу да закључим да си то погрешно схватио. Овај тип графикона зове се Median-joining network, и алгоритам за његову конструкцију није баш тако једноставан како теби изгледа. Median-joining network се гради итеративно, у првој итерацији чворови су реални хаплотипови, али током рада алгоритам у мрежу додаје и чворове који се називају median vectors, који не одговарају реалним хаплотиповима, и којих чак може бити и више од оригиналних чворова (реалних хаплотипова). Такође, у сваком кораку алгоритма се гради такозвана минимална разапињућа мрежа (minimal spanning network). То значи да се неке (директне) гране оригиналног графа избацују да би се обезбедило да збир дужина (растојања) грана које су остале буде минималан (при чему треба сачувати повезаност), па се може десити да растојање између два чвора у разапињућој мрежи не буде исто као у оригиналном графу. Према томе, растојање између два хаплотипа у Median-joining network не мора да одговара њиховој генетској дистанци, па треба бити опрезан у интерпретацији графа.

У сваком случају, мора се прво проучити теорија, прецизно значење Median-joining network и како алгоритам за конструкцију те мреже функционише у пракси, па тек онда давати интерпретације графикона.
 
Poslednja izmena:
Rekao sam već (kada sam govorio o R1a) da grafik ne treba uzimati zdravo za gotovo, da je sve u zoni verovatnoće i da imamo dva različita prikaza u dva rada (u radu bez Srba, ne svodi se prikaz na samo jedan vektor), međutim oba isto govore.
I dalje ne vidim gde sam pogrešio.
Ovo je mreža STR haplotipova.
Krugovi su STR haplotipovi.
Veličina kruga odgovara frekvenciji haplotipa.
Vektori govore o vezama haplotiova, dužina je srazmerna broju mutacija, uz sve pomenute korekcije (naravno da se ne mogu prikazati sve teorijski moguće veze, već se mora izabrati najverovatniji scenario, a postoji i problem sa povratnim mutacijama). U svakom slučaju korekcije se rade da bi prikaz bio bolji, a ne da bi zamaglio rezultate.
Grane su određena grupisanja haplotipova, pominju se u raznim radovima, ne vidim šta je kod njih sorno.
Ako u cenralnoj poziciji u mreži imamo frekventan (uspešan) haplotip, koji je zastupljen u velikoj većini populacija, i od koga kreće veliki breoj grana, mislim da je jasno da od njega sve počinje.
Ako se neka populacija pojavljuje na perifernim pozicijama, kaže se da pripada " recent gene flow", u bukvalnom prevodu.
Ostalo je demografsko - istorijska interpretacija.

U radu gde su je istraživana populacija bez Srbije, u grafiku se jasno vidi da mađarsko - poljsko - ukrajinska populacija zauzima periferne pozicije, a bosanska i albansko - grčka centralne pozicije.
Kada posmatramo gafik koji tretira i Srbiju, čvorište severne grrane je periferno, ne samo po poziciji, već i zbog činjenice da ovog haplotipa nema kod Makedonaca, Grka i Aromuna.

PS
Nego ovi Aromus (žuta boja) su, pretpostavljam Aromuni, ne znam šta bi drugo bili.
Jesam li u pravu?
 
Poslednja izmena:
Rekao sam već (kada sam govorio o R1a) da grafik ne treba uzimati zdravo za gotovo, da je sve u zoni verovatnoće i da imamo dva različita prikaza u dva rada (u radu bez Srba, ne svodi se prikaz na samo jedan vektor), međutim oba isto govore.
I dalje ne vidim gde sam pogrešio.
Ovo je mreža STR haplotipova.
Krugovi su STR haplotipovi.
Veličina kruga odgovara frekvenciji haplotipa.
Vektori govore o vezama haplotiova, dužina je srazmerna broju mutacija, uz sve pomenute korekcije (naravno da se ne mogu prikazati sve teorijski moguće veze, već se mora izabrati najverovatniji scenario, a postoji i problem sa povratnim mutacijama). U svakom slučaju korekcije se rade da bi prikaz bio bolji, a ne da bi zamaglio rezultate.
Grane su određena grupisanja haplotipova, pominju se u raznim radovima, ne vidim šta je kod njih sorno.
Ako u cenralnoj poziciji u mreži imamo frekventan (uspešan) haplotip, koji je zastupljen u velikoj većini populacija, i od koga kreće veliki breoj grana, mislim da je jasno da od njega sve počinje.
Ako se neka populacija pojavljuje na perifernim pozicijama, kaže se da pripada " recent gene flow", u bukvalnom prevodu.
Ostalo je demografsko - istorijska interpretacija.

U radu gde su je istraživana populacija bez Srbije, u grafiku se jasno vidi da mađarsko - poljsko - ukrajinska populacija zauzima periferne pozicije, a bosanska i albansko - grčka centralne pozicije.
Kada posmatramo gafik koji tretira i Srbiju, čvorište severne grrane je periferno, ne samo po poziciji, već i zbog činjenice da ovog haplotipa nema kod Makedonaca, Grka i Aromuna.

Можеш мени да верујеш, можеш такође да проучиш радове на које сам те упутио, а можеш, свакако, и овако, да луташ у магли и тумачиш нешто што не знаш шта значи. Није ти ни први пут да тако радиш, мада тиме само себе лажеш, ништа паметно не можеш да закључиш на тај начин.

Ево ти шта кажу у другом од радова на које сам те упутио:

Median-joining networks
The median-joining network method, begins by combining the MINIMUM-SPANNING TREES (MSTs) within a single network. With a parsimony criterion, median vectors (which represent MISSING INTERMEDIATES) are added to the network. Median-joining networks can handle large data sets and multistate characters. It is an exceptionally fast method that can analyze thousands of haplotypes in a reasonable amount of time and can also be applied to amino acid sequences. However, it requires the absence of recombination, which restricts the application of this method at the population level.

Као што сам већ рекао, конструкција минималног разапињућег стабла не очувава растојање између чворова из оригиналног графа (мреже), а колико сам могао да видим у првом раду на који сам те упутио, ни додавање median vector-а не иде ка очувању растојања. Према томе, твој закључак "Vektori govore o vezama haplotiova, dužina je srazmerna broju mutacija" није добар, дужина не мора бити сразмерна генетској дистанци, а ни неки хаплотипови који би били везани у оригиналној мрежи не морају бити везани у median-joining network. Такође, ни закључак "Grane su određena grupisanja haplotipova,..." ти није исправан, јер у суштини, за дати граф (мрежу) минимално разапуњуће стабло не мора бити јединствено, може постојати више различитих разапињућих стабала, са различитим гранама, што у твојој интерпретацији значи да можемо имати више различитих, независних групација хаплотипова.

У сваком случају, немам више времена за ово, ако хоћеш то да разумеш онако како треба, узми и прочитај како се гради median-joining network, главне линкове сам ти дао.
 
stanje
Zatvorena za pisanje odgovora.

Back
Top