Srpske organizacije za ispitivanje ratnih zlocina optužuju Tokacu da prikriva zločine nad Srbima, a preuveličava muslimanske civilne žrtve evidentirajući ih višestruko ili pretvarajući vojne u civilne žrtve.
Ovo je samo jedan primer manipulacije u vezi žrtava oko Srebrenice:
http://rtrs.tv/vijesti/vijest.php?id=35608
S druge strane, optužuju ga i neki muslimanski ekstremisti što mu samo ide na ruku jer optužbe obe strane nekome mogu sugerisati da je Tokača objektivan iako je samo jedan u nizu veštih eksperata za crnu propagandu koje je iznedrio rat 90-etih.
U toku samog rata Mirsad Tokača je bio na celu nekakve komisije za ratne zločine formirane po nalogu Alije Izetbegovića. Ova institucija je imala krucijalnu ulogu u manipulisanju i laganju svetske javnosti. Komisija je tokom samog rata poturala preko svake mere preuveličane cifre ubijenih muslimana od oko 300 000 ljudi. Posle rata je Tokača postao svestan da je cifra od 300 000 pobijenih civila neodrživa jer se lako može oboriti popisima stanovnišva i drugim metodama, za razliku od nekih muslimanskih ludih glava koji i dalje misle da ne trebaju postojati granice u lažima koje će servirati svetskoj i domaćoj javnosti.
Dakle, svestan da je toliki nivo manipulacija neodrživ u posleratnim uslovima,Tokača posle rata iznosi drugačije cifre i podatak o ubijenih 30 000 muslimanskih civila koji izgleda verodostojnije čime praktično obara cifru od 300 000 ubijenih. Pošto je prostor za manipulaciju posle rata manji nego za vreme samog rata, sada ostaje jedino manipulisati sa pretvaranjem vojnih muslimanskih žrtava u civilne ili neke žrtve evidentirati trostruko, pa je tako tako omjer između vojnih i civilnih žrtava kod Muslimana skoro 1:1, a kod Srba 5:1. Pozitivno je što je Tokača odustao od prenaduvanih cifara o muslimanskim žrtvama koje je sam poturao u jeku propagandnog rata 90- tih, ali mislim da je to odustajanje više vešt manevar u cilju lakšeg poturanja novih laži.
Njegov projekat se delimično finansira novcima stranih ambasada. Pre nekoliko godina ambasade Švedske, Švajcarske i Norveške su optužile Tokaču za nezakonitosti u utrošku donacija o čemu su izvestili svi mediji. Na molbu novinara da prokomentariše ove optužbe Tokača se pravdao, verovali ili ne, tvrdnjom da ga žele iskompromitovati jer je objektivan i srušio je naduvane ranije cifre o broju stradalih. Uzgred, te naduvane cifre o muslimanskim žrtvama je u ulozi Izetbegovićevog propagandiste iznosio sam Tokača (pa je kasnije on sam i smanjio vlastite cifre), a ne ambasade Švedske, Švajcarske i Norveške.
U jednom intevjuu na pitanje sta zna o bošnjačkim logorima za Srbe Tokaca odgovora sledeće :
''Moram vas upozoriti da nisu postojali nikakvi bošnjački logori za Srbe.''
Ovo je jedno besramno izrugivanje sa žrtvama rata.
Sumirajući podatke o ovom čoveku i imajući u vidu sve što je iznosio o ratnim žrtvama tokom i posle rata, zatim optužbe stranih ambasada za proneveru novca (kao i njegov komentar na te optužbe), dobija se jasnija slika o jednom beskarakternom hohštapleru i opasnom grabežljivcu doniranog novca koji je dobio preveliki prostor u medijima i poverenje naivne javnosti. Razne stvari i svakojake ličnosti su izronile na površinu u mutnim vremenima iza nas, pa i ovaj Tokača.