(Biologija) Globularni proteini
Prikazujem rezultate 1 do 13 od 13

Tema: (Biologija) Globularni proteini

  1. #1
    Iskusan fantom piroman (avatar)
    Učlanjen
    03.01.2006.
    Pol
    muški
    Lokacija
    He stood in a field where barley grows
    Poruke
    5.515
    Tekstova u blogu
    3
    Reputaciona moć
    99

    Podrazumevano (Biologija) Globularni proteini

    E sada me nesto zanima- cesto se kazu da su globularni proteini u stvari proteini loptastog oblika. Medjutim ja u tom obliku vidim sve sem lopte. Kakve to veze sada ima? I po cemu se razlikuju od fibrilnih proteina?
    Treba mi svet, otvoren za poglede....



  2. #2
    Ističe se endonuclease (avatar)
    Učlanjen
    26.11.2005.
    Pol
    muški
    Lokacija
    USA
    Poruke
    2.001
    Reputaciona moć
    64

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio fantom piroman Pogledaj poruku
    E sada me nesto zanima- cesto se kazu da su globularni proteini u stvari proteini loptastog oblika. Medjutim ja u tom obliku vidim sve sem lopte. Kakve to veze sada ima? I po cemu se razlikuju od fibrilnih proteina?
    Meh. Podela na globularne i fibrilne proteine je prilično arbitrarna, i u striktnom biohemijskom smislu besmislena.

    "Globularan" ovde znači u principu "odvojeno parče materije". Ovi proteini su u stvari nepravilnog oblika (ja bih pre rekao da liče na asteroide nego na kugle), i uglavnom su rastvorljivi u vodi (naravno, u zavisnosti od koncentracije drugih proteina, temperature, pH, koncentracije soli, i mase drugih faktora).

    "Fibrilni" proteini su tipa kolagena ili keratina: dugačke niti koje se međusobno povezuju i stvaraju nerastvorljive "kablove" koji organizuju tkiva i međućelijske matrice.

    Biohemičari koriste ove termine retko, i samo u najgeneralnijem smislu. Ja ih lično potpuno izbegavam.

    Najveći deo proteina se ne uklapa u ove kategorije. Recimo, nijedan transmembranski protein ne može zaista da se nazove ni globularnim ni fibrilnim. Ili čak prostije, alfa i beta tubulin - šta su oni? Sami po sebi, definitivno su globularni proteini...ali kada se organizuju u mikrotubule, šta su onda? Nisu više globularni, ali sigurno nisu ni fibrilni.

  3. #3
    marko8380 nije na forumu
    Koliko god pametno govorio, uvek neku glupost kazes. Fridrih Nice
    Zainteresovan član marko8380 (avatar)
    Učlanjen
    04.04.2009.
    Pol
    ženski
    Lokacija
    V zeleni deželi
    Poruke
    180
    Reputaciona moć
    33

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio fantom piroman Pogledaj poruku
    E sada me nesto zanima- cesto se kazu da su globularni proteini u stvari proteini loptastog oblika. Medjutim ja u tom obliku vidim sve sem lopte. Kakve to veze sada ima? I po cemu se razlikuju od fibrilnih proteina?
    Ja cu probati da ti objasnim zasto kad je vec endonukleaza reko razlike.

    Protrini se medju sobom povezuju sa raznim vezama - medmolekularne veze:
    - H- veza
    - van der valsove veze
    - orjentacijske veze

    -one su slabije nego medatomske veze (ionska, kovalentna, nekovalentne) al su vazne za sastvaljanje mega proteina.

    Samu strukturu proteina odredjuje i voda - hidrofilni delovi -(vodu vole se povezuju sa njom), hidrofobni delovi (je nevole i se zakopavaju u globinu proteina ili medju memrane celija).

    Za aktivnost proteina pa nije samo odgovorna voda nego i procesiranje mRNA ili samog proteina (šaperoni su odgovorni da se proteini saviju kako teba ) sastavljanje iz vise delova i podenota. Jer da bi bio protein aktivan treba i s-s mostovi (veze) se uspostave.



    To se najbolje vidi kod kose - kovrdjava kosa ima mnogo s-s mostova kad denaturiramo sa peglom u kosi proteine porusimo jim s-s mostove i ona postaje prava - dok vlaga je nazad kovrdja.

    Sad pitanje zasto belance kod jajca pobeli kad ga pecemo? - koagulira
    "Beware of those who try to sell you simple answers to complex questions." — Scott Adams.

  4. #4
    Iskusan fantom piroman (avatar)
    Učlanjen
    03.01.2006.
    Pol
    muški
    Lokacija
    He stood in a field where barley grows
    Poruke
    5.515
    Tekstova u blogu
    3
    Reputaciona moć
    99

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Zahvaljujem
    Treba mi svet, otvoren za poglede....

  5. #5
    Elita gost 39034 (avatar)
    Učlanjen
    10.08.2005.
    Pol
    ženski
    Poruke
    20.637
    Tekstova u blogu
    12
    Reputaciona moć
    0

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    najjednostavnije objasnjenje bi bilo da su fibrilalrni oblika niti, a globularni loptastog...koliko znam, oblik koji imaju utice jako na sposbnost njihove agregacije i posledicno na njihovu fiziolosku ulogu, ili patologiju do koje agregati mogu da dovedu-primer je alfa-sinuklein, koji je neophodan za normalnu sinapticku funkciju, a kao agregiran se javlja u Parkinsonovoj bolesti, za agregaciju je fibrilarno stanje, koliko se secam, presudno

  6. #6
    Veoma poznat diretore (avatar)
    Učlanjen
    18.07.2003.
    Pol
    muški
    Lokacija
    38:54:18N 77:00:58W
    Poruke
    12.957
    Reputaciona moć
    182

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    najjednostavnije objasnjenje bi bilo da su fibrilalrni oblika niti, a globularni loptastog...
    tacno, ali to je vec receno...
    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    koliko znam, oblik koji imaju utice jako na sposbnost njihove agregacije i posledicno na njihovu fiziolosku ulogu, ili patologiju do koje agregati mogu da dovedu
    tacno i netacno, razlikuje se vise stanja u foldingu (tj. sklapanju) strukture proteina. Postoji jedna (u nekim slucajevima i vise, razlicite konformacije proteina) pravilno sklopljena struktura proteina (eng. folded protein), svi ostali oblici (strukture) su ili medjuproizvodi sklapanja te pravilne strukture ili rastvorljivi ili nerastvorljivi agregati neuspjelog sklapanja. Postoje proteini ili dijelovi proteina koji takodje nemaju strukturu, a opet imaju fiziolosku ulogu (o tome bi se moglo pisati duze)

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    primer je alfa-sinuklein, koji je neophodan za normalnu sinapticku funkciju, a kao agregiran se javlja u Parkinsonovoj bolesti, za agregaciju je fibrilarno stanje, koliko se secam, presudno
    ...pogresno...alfa-sinuklein je jedan od gore navedenih proteina koji su prirodno solubilni a nemaju strukturu i kao takav ispunjava svoju fizilosku funkciju. Ono sto ti navodis je patolosko stanje izazvano u ovom slucaju mutacijama u proteinu koje vode ka tome da jedan njegov dio dobija stabilnu strukturu beta-plocice. Takve beta-plocice posjeduju mogucnost formiranja amiloidnih fibrila, koji imaju genaralno fibrilarnu strukturu, ali u principu predstavljaju polimere nepravilno strukturiranih ili agregiranih proteina(ili jednog proteina). Najcesci uzrok tome su mutacije u proteinima koje kao sto rekoh vode k' tome da se u jednom dijelu proteina formira stabilna beta-plocica, mala kompleksnost u sekvenci aminokiselina (poli-glutamin) takodje vodi u isti scenario.
    ...sa druge strane, moguce je dobiti amiloidne fibrile i bez mutacija...u tom slucaju mjenja se fizicko-hemijska okolina proteina...promjene pH, temperature, pritiska...
    ...takodje je moguce napraviti sinteticki amiloidni fibril...za one koji su zainteresovani, mozete pogledati radove David Eisenberg-a sa Univerziteta Kalifornije u Los Andjelosu (UCLA)...http://www.doe-mbi.ucla.edu/people/eisenberg
    "This time next year, we'll be millionaires"

  7. #7
    Ističe se endonuclease (avatar)
    Učlanjen
    26.11.2005.
    Pol
    muški
    Lokacija
    USA
    Poruke
    2.001
    Reputaciona moć
    64

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    koliko znam, oblik koji imaju utice jako na sposbnost njihove agregacije i posledicno na njihovu fiziolosku ulogu
    Da dodam na Diretoreovu poruku jedan opštepoznat primer - hemoglobin A, sa E6V mutacijom.

    Hemoglobin je klasičan globularni protein (globin, jelte), ali sa ovom mutacijom se agregira u fibrilarne kristale koji deformišu ćeliju. Da li je sada ovaj protein globularan ili fibrilan? Arbitrarno...

  8. #8
    Elita gost 39034 (avatar)
    Učlanjen
    10.08.2005.
    Pol
    ženski
    Poruke
    20.637
    Tekstova u blogu
    12
    Reputaciona moć
    0

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio diretore Pogledaj poruku
    tacno, ali to je vec receno...

    tacno i netacno, razlikuje se vise stanja u foldingu (tj. sklapanju) strukture proteina. Postoji jedna (u nekim slucajevima i vise, razlicite konformacije proteina) pravilno sklopljena struktura proteina (eng. folded protein), svi ostali oblici (strukture) su ili medjuproizvodi sklapanja te pravilne strukture ili rastvorljivi ili nerastvorljivi agregati neuspjelog sklapanja. Postoje proteini ili dijelovi proteina koji takodje nemaju strukturu, a opet imaju fiziolosku ulogu (o tome bi se moglo pisati duze)



    ...pogresno...alfa-sinuklein je jedan od gore navedenih proteina koji su prirodno solubilni a nemaju strukturu i kao takav ispunjava svoju fizilosku funkciju. Ono sto ti navodis je patolosko stanje izazvano u ovom slucaju mutacijama u proteinu koje vode ka tome da jedan njegov dio dobija stabilnu strukturu beta-plocice. Takve beta-plocice posjeduju mogucnost formiranja amiloidnih fibrila, koji imaju genaralno fibrilarnu strukturu, ali u principu predstavljaju polimere nepravilno strukturiranih ili agregiranih proteina(ili jednog proteina). Najcesci uzrok tome su mutacije u proteinima koje kao sto rekoh vode k' tome da se u jednom dijelu proteina formira stabilna beta-plocica, mala kompleksnost u sekvenci aminokiselina (poli-glutamin) takodje vodi u isti scenario.
    ...sa druge strane, moguce je dobiti amiloidne fibrile i bez mutacija...u tom slucaju mjenja se fizicko-hemijska okolina proteina...promjene pH, temperature, pritiska...
    ...takodje je moguce napraviti sinteticki amiloidni fibril...za one koji su zainteresovani, mozete pogledati radove David Eisenberg-a sa Univerziteta Kalifornije u Los Andjelosu (UCLA)...http://www.doe-mbi.ucla.edu/people/eisenberg
    sinuklein ne mora biti mutiran da bi agregirao, sta je sa sporadicnim slucajevima PD-a, gde je Syn takodje agregiran u Levijevim telima? u njegovom slucaju mt samo lakse dovodi do toga da iz alfa-heliksa predje u beta-plocu
    p.s. lepo sto vas opet vidim kolega, a posto vidim i da blotujete, budite ljubazni, pa mi recite koji sistem za kvantifikaciju western blota koristite? i da li ste radili sa pulovanim uzorcima i kako onda kvantifikujete? koja statistika?

  9. #9
    Veoma poznat diretore (avatar)
    Učlanjen
    18.07.2003.
    Pol
    muški
    Lokacija
    38:54:18N 77:00:58W
    Poruke
    12.957
    Reputaciona moć
    182

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    sinuklein ne mora biti mutiran da bi agregirao, sta je sa sporadicnim slucajevima PD-a, gde je Syn takodje agregiran u Levijevim telima? u njegovom slucaju mt samo lakse dovodi do toga da iz alfa-heliksa predje u beta-plocu
    ... u slucajevima kada sinuklein nije mutiran a vodi k' agregiranju, tj. formiranju amiloidnih fibrila pricamo o necemu/ili nekome sto mjenja normalan ekvilibrijum u sklapanju (fold-ovanju) sinukliena. Ako sinuklein u normalnom fizioloskom stanju nema odredjenu strukturu ili odredjen dio proteina osciliuje izmedju dva stanja alfa-heliksa i beta plocice (tj nalazi se u ekvilibrijumu izmedju ta dva stanja), bilo koji agens koji pomjera ekvilibrijum ka stabilnom stanju beta plocice moze da izazove stvaranje amiloidnih fibrila. Agensi u ovom slucaju mogu biti mali molekuli (odredjen ligand, kofaktor, i sl), proteini (promjena u interakcijama vezana za mutacije u drugim proteinima, bez mutacija u sinukleinu), kao i sama promjena celijske homeostaze (vec sam napisao pH, razlicita koncentracija odredjenih jona, i sl).
    Opste je poznato da proteini u sekundarnom prenosu signala posjeduje tzv. linearne motive ili odredjene dijelove proteina koji nemaju sekundarnu strukturu. Takvi motivi u procesu prenosa signala pod uticajem hemijskih (fosforilacija, metilovanje i sl. odredjenih aminokiselina) ili fizickih promjena (interakcija sa odredjenim proteinom, vezivanje liganda, i sl.), ili obe navedene, najcesce dobijaju metastabilnu sekundarnu strukturu (heliks ili beta plocica). Pomjeranje ekvilibrijuma u korist stabilne sekundarne stukture u ovom slucaju vodi k' konstantnoj aktivnosti ili neaktivnosti odredjenog proteina i pojavom patoloskih stanja (vrlo cest slucaj kod razlicitih tipova raka, ali i kod drugih oboljenja).

    ...i opet tvoj odgovor o amiloidnim fibrilima nije odgovor na pitanje koje je piroman postavio jer amiloidni fibrili predstavljaju neprirodni oblik agregata(polimera) jednog ili vise proteina a ne normalnu strukturu proteina.

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    p.s. lepo sto vas opet vidim kolega, a posto vidim i da blotujete, budite ljubazni, pa mi recite koji sistem za kvantifikaciju western blota koristite? i da li ste radili sa pulovanim uzorcima i kako onda kvantifikujete? koja statistika?
    nesto i ne blotujem u poslednje vrijeme...a sto se tice sistema za kvantifikaciju najcesce koristim ImageQuant (Molecular Dynamics). Ne razumijem sta znaci pulovani uzorci? (vise linija ili tacaka na jednom western-u, ili sakupljene frakcije nanijete u jednom uzorku ili nesto trece)
    "This time next year, we'll be millionaires"

  10. #10
    Elita gost 39034 (avatar)
    Učlanjen
    10.08.2005.
    Pol
    ženski
    Poruke
    20.637
    Tekstova u blogu
    12
    Reputaciona moć
    0

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio diretore Pogledaj poruku

    ...i opet tvoj odgovor o amiloidnim fibrilima nije odgovor na pitanje koje je piroman postavio jer amiloidni fibrili predstavljaju neprirodni oblik agregata(polimera) jednog ili vise proteina a ne normalnu strukturu proteina.

    nesto i ne blotujem u poslednje vrijeme...a sto se tice sistema za kvantifikaciju najcesce koristim ImageQuant (Molecular Dynamics). Ne razumijem sta znaci pulovani uzorci? (vise linija ili tacaka na jednom western-u, ili sakupljene frakcije nanijete u jednom uzorku ili nesto trece)
    on nije ni pitao o razlici izmedju strukture normalnih i mutiranih proteina
    a, ja sam u poslednjem postu odgovorila na tvoj citat mog posta, a ne njemu
    sto se tice pulovanih proteina, never mind, cim ne znas na sta mislim, znaci da sa takvim uzorcima proteina ne radis, te mi ni ne mozes pomoci

  11. #11
    Veoma poznat diretore (avatar)
    Učlanjen
    18.07.2003.
    Pol
    muški
    Lokacija
    38:54:18N 77:00:58W
    Poruke
    12.957
    Reputaciona moć
    182

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Citat Original postavio fantom piroman Pogledaj poruku
    E sada me nesto zanima- cesto se kazu da su globularni proteini u stvari proteini loptastog oblika. Medjutim ja u tom obliku vidim sve sem lopte. Kakve to veze sada ima? I po cemu se razlikuju od fibrilnih proteina?

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    on nije ni pitao o razlici izmedju strukture normalnih i mutiranih proteina
    tacno tako...on je pitao o strukturi normalnih proteina, a tvoj odgovor sinukleinu govori o patoloskom stanju proteinskih agregata (neprirodnog stanja) koji nastaje ili zbog mutacija ili zbog drugih uzroka i samim tim ne predstavlja dobar primjer...prema tome ne vidim razlog zbog cega ovolika diskusija o tome...

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    a, ja sam u poslednjem postu odgovorila na tvoj citat mog posta, a ne njemu
    ...pa i ja sam odgovorio na tvoj post...ali sam dao objasnjenje da amiloidni fibrili nemaju nikakve veze sa prvim pitanjem na ovoj temi

    Citat Original postavio malavelika Pogledaj poruku
    sto se tice pulovanih proteina, never mind, cim ne znas na sta mislim, znaci da sa takvim uzorcima proteina ne radis, te mi ni ne mozes pomoci

    bar se nadam da ce ti softver pomoci...
    Poslednji put ažurirao/la diretore : 06.10.2009. u 20:21
    "This time next year, we'll be millionaires"

  12. #12
    Primećen član chuck. (avatar)
    Učlanjen
    12.02.2009.
    Pol
    muški
    Lokacija
    Pendelton State University
    Poruke
    998
    Reputaciona moć
    42

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    link: Otkriven gen koji omogućava dug život

    Autor: Blic online | Foto:Reuters | 17.11.2009. - 08:52
    Naučnici su proučavali grupu ljudi čija je starost u proseku bila 97 godina i otkrili da su svi oni nasledili poseban gen koji usporava starenje ćelija, prenosi "Dejli telegraf".





    -
    I am not going anywhere. I am here.

  13. #13
    Ističe se endonuclease (avatar)
    Učlanjen
    26.11.2005.
    Pol
    muški
    Lokacija
    USA
    Poruke
    2.001
    Reputaciona moć
    64

    Podrazumevano Re: (Biologija) Globularni proteini

    Blic nastavlja tradiciju izveštavanja o nauci sa stanovišta potpunog nepoznavanja iste.

    U članku se priča o telomerazi, koja je poznata već decenijama. Takođe je decenijama poznato da se povećanjem nivoa telomeraze može povećati i životni vek. Jedan mali problem je to što ovo takođe izaziva strahovito povećanje verovatnoće za razvoj raka - većina rakova ima tzv. konstitutivno aktivnu telomerazu.

    Dakle, cela ova vest se u stvari svodi na "još jednom je potvrđeno, po sto trideseti put, da telomeraza utiče na dugovečnost".

Slične teme

  1. Proteini
    Autor Nikola_Selencha89 u forumu Ostali sportovi
    Odgovora: 34
    Poslednja poruka: 08.06.2009., 23:16
  2. Proteini ili ne?
    Autor cvele2 u forumu Prirodne nauke
    Odgovora: 22
    Poslednja poruka: 17.10.2006., 11:49

Pravila za slanje poruka

  • Ne možete kreirati novu temu
  • Ne možete poslati odgovor
  • Ne možete dodati priloge
  • Ne možete prepraviti svoju poruku
  •